Foster có mối quan hệ với nữ diễn viên người Đức Antje Traue, bạn diễn của anh trong Pandorum. Traue tiết lộ trong một cuộc phỏng vấn rằng cô đã chuyển đến Los Angeles và sống với Foster cho đến khi mối quan hệ của họ tan vỡ vào khoảng năm 2010.[23] Foster bắt đầu mối quan hệ với nữ diễn viên Robin Wright vào đầu năm 2012.[24][25] Họ đính hôn vào đầu năm 2014,[26] nhưng đã hủy đính hôn vào ngày 12 tháng 11 năm 2014.[27] Foster và Wright hòa giải vào đầu năm 2015;[28] tuy nhiên, vào ngày 29 tháng 8 năm 2015, họ thông báo rằng đã hủy hôn lần thứ hai.[29]

Vào tháng 10 năm 2016, Foster cho biết anh đính hôn với nữ diễn viên Laura Prepon.[30] Prepon sinh cô con gái đầu lòng, Ella, vào tháng 8 năm 2017.[31] Foster và Prepon kết hôn vào tháng 6 năm 2018. Vào tháng 10 năm 2019, có thông tin cho rằng cặp đôi đang mong đợi đứa con thứ hai của họ.[32] Con trai của họ sinh vào tháng 2 năm 2020.[33]

Ngoài ra, Ben Foster cũng thực hành ngồi thiền theo kiểu Thiền Siêu Việt.[34]